Die Stadt-Apotheke befindet sich in der Stadtmitte von Waldkirch direkt neben dem Rathaus, die Bushaltestelle “Waldkirch Stadtmitte” unmittelbar vor der Apotheke.
Der barrierefreie und rollstuhlgerechte Eingang befindet sich am Rückgebäude im Innenhof der Apotheke. Der Innenhof kann über den Marktplatz oder über die Turmstraße erreicht werden. Autofahrer finden ausreichend Parkplätze in der näheren Umgebung.